| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
|
Data corrente: |
19/12/2013 |
|
Data da última atualização: |
26/12/2013 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
SILVA, F. F.; ROCHA, G. S.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PETERNELLI, L. A.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. |
|
Afiliação: |
F. F. Silva, Universidade Federal de Viçosa; G. S. Rocha, Aluno de pós-graduação – Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; S. E. F. Guimarães, Universidade Federal de Viçosa; L. A. Peternelli, Universidade Federal de Viçosa; D. A. S. Duarte, Aluno de graduação - Universidade Federal de Viçosa / Bolsista de Iniciação Científica; C. Azevedo, Universidade Federal de Viçosa. |
|
Título: |
Seleção genômica ampla para curvas de crescimento. |
|
Ano de publicação: |
2013 |
|
Fonte/Imprenta: |
Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 65, n. 5, p. 1519-1526, 2013. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Foi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano ? BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente superiores em relação à eficiência de crescimento. Os dados simulados utilizados neste estudo foram constituídos de 2000 indivíduos (1000 na população de treinamento e 1000 na população de validação) contendo 453 marcadores SNPs distribuídos sobre cinco cromossomos. Os resultados indicaram a alta eficiência do método BL em predizer GBVs da população de validação com base na população de treinamento (coeficientes de correlação variaram entre 0,79 e 0,93), bem como a alta eficiência na detecção de QTLs, uma vez que os marcadores com maiores efeitos estimados encontravam-se em posições dos cromossomos próximas àquelas nas quais se encontravam os verdadeiros QTLs postulados na simulação. |
|
Palavras-Chave: |
Bayesian LASSO; Dados longitudinais; LASSO bayesiano; Longitudinal data; Melhoramento genético; SNP. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94366/1/2013-M.Deon-ABMVZ-Selecao.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02280naa a2200265 a 4500
001 1974473
005 2013-12-26
008 2013 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSILVA, F. F.
245 $aSeleção genômica ampla para curvas de crescimento.$h[electronic resource]
260 $c2013
520 $aFoi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano ? BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente superiores em relação à eficiência de crescimento. Os dados simulados utilizados neste estudo foram constituídos de 2000 indivíduos (1000 na população de treinamento e 1000 na população de validação) contendo 453 marcadores SNPs distribuídos sobre cinco cromossomos. Os resultados indicaram a alta eficiência do método BL em predizer GBVs da população de validação com base na população de treinamento (coeficientes de correlação variaram entre 0,79 e 0,93), bem como a alta eficiência na detecção de QTLs, uma vez que os marcadores com maiores efeitos estimados encontravam-se em posições dos cromossomos próximas àquelas nas quais se encontravam os verdadeiros QTLs postulados na simulação.
653 $aBayesian LASSO
653 $aDados longitudinais
653 $aLASSO bayesiano
653 $aLongitudinal data
653 $aMelhoramento genético
653 $aSNP
700 1 $aROCHA, G. S.
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F.
700 1 $aPETERNELLI, L. A.
700 1 $aDUARTE, D. A. S.
700 1 $aAZEVEDO, C.
773 $tArquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia$gv. 65, n. 5, p. 1519-1526, 2013.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
|
Data corrente: |
16/12/2017 |
|
Data da última atualização: |
31/01/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
|
Autoria: |
NEGRI, B. F.; BERNARDINO, K. da C.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de; SOUSA, S. M. de. |
|
Afiliação: |
Bárbara França Negri, Bolsista; Karine da Costa Bernardino, Bolsista; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; SYLVIA MORAIS DE SOUSA TINOCO, CNPMS. |
|
Título: |
Caracterização morfológica de acessos do painel de diversidade de sorgo avaliados em solução nutritiva sob baixo fósforo. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2017. |
|
Páginas: |
25 p. |
|
Série: |
(Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 158). |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
O fósforo (P) é um macronutriente essencial para plantas, e sua aquisição depende do sistema radicular da planta. Em terras aráveis, P é um dos macronutrientes mais indisponíveis e frequentemente limita o crescimento e a produtividade das plantas cultivadas. Portanto, uma melhor compreensão de como as plantas respondem à deficiência de P é necessária para produzir variedades com maior eficiência de uso deste nutriente. Este estudo teve como objetivo analisar as característivas radiculares relacionadas à eficiência de aquisição de P em um painel de sorgo, composto por acessos do programa de melhoramento da Embrapa Milho e Sorgo e do CIRAD, totalizando 190 genótipos. As sementes de sorgo foram germinadas durante quatro dias em rolos de germinação e depois colocadas em um sistema de pastas de papel com solução nutritiva modificada de Magnavaca (P - 2,5 μM) em condições controladas. Após 13 dias, as imagens das raizes foram capturadas usando um sistema de fotografia digital e analisadas utilizando o programa RootReader2D e o software WinRHIZO. A raiz e a parte aérea foram secas separadamente a 65 °C em uma estufa de ar forçado até a obtenção de peso constante. O comprimento total da raiz correlacionou positivamente com o volume radicular total e de raízes superfinas e peso seco e negativamente com o diâmetro médio. O baixo coeficiente de variação (10,04 - 25,33%) e a herdabilidade média a alta (30,9 - 85,18%) foram encontrados para todas as características radiculares (comprimento total da raiz, diâmetro médio da raiz, volume total da raiz e volume de raízes superfinas) e de peso seco analisadas. A Análise de Componentes Principais foi capaz de diferenciar genótipos de sorgo contrastantes com base nas características avaliadas. O primeiro componente principal (PC1) explicou 62%, enquanto o segundo componente principal (PC2) explicou 18% da variabilidade fenotípica. Esses dados darão suporte à análise de associação para identificar genes candidatos relacionados à morfologia da raiz e à eficiência de aquisição de P no sorgo. MenosO fósforo (P) é um macronutriente essencial para plantas, e sua aquisição depende do sistema radicular da planta. Em terras aráveis, P é um dos macronutrientes mais indisponíveis e frequentemente limita o crescimento e a produtividade das plantas cultivadas. Portanto, uma melhor compreensão de como as plantas respondem à deficiência de P é necessária para produzir variedades com maior eficiência de uso deste nutriente. Este estudo teve como objetivo analisar as característivas radiculares relacionadas à eficiência de aquisição de P em um painel de sorgo, composto por acessos do programa de melhoramento da Embrapa Milho e Sorgo e do CIRAD, totalizando 190 genótipos. As sementes de sorgo foram germinadas durante quatro dias em rolos de germinação e depois colocadas em um sistema de pastas de papel com solução nutritiva modificada de Magnavaca (P - 2,5 μM) em condições controladas. Após 13 dias, as imagens das raizes foram capturadas usando um sistema de fotografia digital e analisadas utilizando o programa RootReader2D e o software WinRHIZO. A raiz e a parte aérea foram secas separadamente a 65 °C em uma estufa de ar forçado até a obtenção de peso constante. O comprimento total da raiz correlacionou positivamente com o volume radicular total e de raízes superfinas e peso seco e negativamente com o diâmetro médio. O baixo coeficiente de variação (10,04 - 25,33%) e a herdabilidade média a alta (30,9 - 85,18%) foram encontrados para todas as características radiculares (comp... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Sorghun bicolor. |
|
Thesagro: |
Genética; Sistema radicular. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/171865/1/bol-158.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02842nam a2200217 a 4500
001 2082720
005 2018-01-31
008 2017 bl uuuu u0uu1 u #d
100 1 $aNEGRI, B. F.
245 $aCaracterização morfológica de acessos do painel de diversidade de sorgo avaliados em solução nutritiva sob baixo fósforo.$h[electronic resource]
260 $aSete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo$c2017
300 $a25 p.
490 $a(Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 158).
520 $aO fósforo (P) é um macronutriente essencial para plantas, e sua aquisição depende do sistema radicular da planta. Em terras aráveis, P é um dos macronutrientes mais indisponíveis e frequentemente limita o crescimento e a produtividade das plantas cultivadas. Portanto, uma melhor compreensão de como as plantas respondem à deficiência de P é necessária para produzir variedades com maior eficiência de uso deste nutriente. Este estudo teve como objetivo analisar as característivas radiculares relacionadas à eficiência de aquisição de P em um painel de sorgo, composto por acessos do programa de melhoramento da Embrapa Milho e Sorgo e do CIRAD, totalizando 190 genótipos. As sementes de sorgo foram germinadas durante quatro dias em rolos de germinação e depois colocadas em um sistema de pastas de papel com solução nutritiva modificada de Magnavaca (P - 2,5 μM) em condições controladas. Após 13 dias, as imagens das raizes foram capturadas usando um sistema de fotografia digital e analisadas utilizando o programa RootReader2D e o software WinRHIZO. A raiz e a parte aérea foram secas separadamente a 65 °C em uma estufa de ar forçado até a obtenção de peso constante. O comprimento total da raiz correlacionou positivamente com o volume radicular total e de raízes superfinas e peso seco e negativamente com o diâmetro médio. O baixo coeficiente de variação (10,04 - 25,33%) e a herdabilidade média a alta (30,9 - 85,18%) foram encontrados para todas as características radiculares (comprimento total da raiz, diâmetro médio da raiz, volume total da raiz e volume de raízes superfinas) e de peso seco analisadas. A Análise de Componentes Principais foi capaz de diferenciar genótipos de sorgo contrastantes com base nas características avaliadas. O primeiro componente principal (PC1) explicou 62%, enquanto o segundo componente principal (PC2) explicou 18% da variabilidade fenotípica. Esses dados darão suporte à análise de associação para identificar genes candidatos relacionados à morfologia da raiz e à eficiência de aquisição de P no sorgo.
650 $aGenética
650 $aSistema radicular
653 $aSorghun bicolor
700 1 $aBERNARDINO, K. da C.
700 1 $aPASTINA, M. M.
700 1 $aMAGALHAES, J. V. de
700 1 $aSOUSA, S. M. de
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
